交趾黃檀與微凹黃檀在“紅木”國家標準（GB/T 18107—2000《紅木》）中同屬紅酸枝木類，它們之間有著許多的相同或相似之處，如科屬、植物類型、樹木分布緯度、樹干規格、材質、結構、管孔類型、射線組織細胞、軸向薄壁組織、穿孔板等特征，同時也存在著不同點。由特征對比分析表中兩種樹種相似度較低的特征可對其進行識別區分，分宏觀識別和微觀識別兩部分進行。宏觀識別順序是干形——心材顏色——材質——生長輪明顯度——波痕——氣味——紋理。微觀識別順序是軸向薄壁組織——管孔組合——內含物——射線類型。

宏觀區分要點

①干形——交趾黃檀比較通直，而微凹黃檀有一大特點就是髓心部位常有空洞現象，而且空洞中往往有樹根生長進去；

②心材新切面顏色——交趾黃檀是暗紅或紫紅色，微凹黃檀是橘紅色，特別要注意的是要看新切面，因為微凹黃檀材色久則變深，變深后的顏色與交趾黃檀的顏色非常接近，此時在顏色上時非常難辨別的，這也是微凹黃檀能冒充交趾黃檀的一個原因所在；

③材質——二者的材質均比較光滑、穩定性也比較好，但微凹黃檀的油質感比交趾黃檀的強；

④生長輪明顯度——橫切面上看微凹黃檀的生長輪相對的比較明顯；

⑤波痕——弦切面上交趾黃檀的波痕比微凹黃檀的波痕明顯度高；

⑥氣味——二者均有氣味，但交趾黃檀為酸香氣，而微凹黃檀為辛辣味。

⑦紋理——由于微凹黃檀管孔中含黑色樹膠，故在徑切面及弦切面上可看見大量的黑細線及黑點，交趾黃檀中也有，但相對較寬及少得多。